Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation 2023. Preprint
Article first published online: 31 DEC 2022 | DOI: 10.17581/bp.2023.12105
Amendments to the description of Chloromonas actinochloris (Chlorophyta) inferred from the study of the South Siberian finding
Irina N. Egorova 1
,
Nina V. Kulakova 1 &
Olga N. Boldina 2 1 Siberian Institute of Plant Physiology and Biochemistry SB RAS, Irkutsk, Russia
2 Komarov Botanical Institute RAS, St. Petersburg, Russia
Chlamydomonas-like green microalgae are unicellular biflagellate organisms from the order Volvocales, which are widely distributed in terrestrial ecosystems. Recent studies have shown that they belong to different phylogenetic lineages. The exact establishment of the taxonomic affiliation of these representatives is based on integrative approach, including multigene phylogeny along with light and electron microscopy, which also allows us to get the most accurate information about their biogeography. In this study, we examined the terrestrial green Chlamydomonas-like microalga, isolated from soil of the South-Eastern Altai Mountains in Russia. Based on molecular data of the nuclear 18S and plastid rbcL gene, we refer this alga to Chloromonas actinochloris within a robust clade of the genus Chloromonas, the phylogroup Chloromonadinia. This species was described from North America (USA). It is the first discovery of C. actinochloris in the mountains of Southern Siberia, as well as the first record of the species in Russia confirmed by molecular phylogeny and microscopy methods. The description of C. actinochloris, information on its biology and geography was supplemented. It is generally accepted that the phylogenetic clade including C. actinochloris should be revised and reassigned to a new genus soon. Our study shows that vegetative cells of Chloromonadinia algae can have ornamented cell wall that was mainly known for resting cells (cysts/zygotes) in a number of chlamydomonads, more rarely for vegetative cells. The structures on the wall of vegetative cells of Chlamydomonaslike microalgae can serve as an additional diagnostic criterion.
Егорова И.Н., Кулакова Н.В., Болдина О.В. Дополнения к описанию Chloromonas actinochloris (Chlorophyta) на основе находки в Южной Сибири. Chlamydomonas-подобные зеленые микроводоросли – широко распространенные в наземных экосистемах одноклеточные двужгутиковые организмы из порядка Volvocales. Современные исследования показали, что они принадлежат разным филогенетическим линиям. Установление таксономической принадлежности Chlamydomonas-подобных водорослей требует применения методов молекулярной филогении наряду со световой и электронной микроскопией, что также позволяет получить наиболее точную информацию об их географии. В настоящей работе нами была изучена зеленая монадная микроводоросль, найденная в почве юго-восточного Алтая (Россия, Республика Алтай, Кош-Агачский район). На основе молекулярных данных она отнесена к самостоятельной кладе в составе филогруппы Chloromonadinia, роду Chloromonas, виду C. actinochloris. Вид известен из Северной Америки (США). Это первая находка C. actinochloris в горах Южной Сибири, а также первая подтвержденная при помощи методов молекулярной филогении и микроскопии находка вида в России. На основе полученных нами данных дополнено описание C. actinochloris, сведения о его биологии и географии. Ранее показано, что виды в составе клады, к которой принадлежит C. actinochloris, должны быть отнесены к новому роду. Однако, таксономическая ревизия Chloromonadinia еще не проведена. Наши исследования также подтверждают, что вегетативные клетки представителей Chloromonadinia могут иметь оболочку с орнаментом. Скульптурированные оболочки известны преимущественно для покоящихся клеток (цист/зигот) ряда хламидомонад, реже для вегетативных клеток. Структуры на оболочке вегетативных клеток Chlamydomonas-подобных микроводорослей могут служить дополнительным диагностическим критерием.
Keywords: terrestrial green microalgae, Chloromonadinia, Chloromonas actinochloris, Russian Altai Mountains, taxonomy, integrative approach, почвенные зеленые микроводоросли, горный Алтай, таксономия, интегративные исследования
References
Aleksakhina, T.A. & E.A. Shtina 1984. Soil algae of forests biogeocenoses. Nauka, Moscow, 130 pp. (in Russian). [Алексахина Т.А., Штина Э.А. 1984. Почвенные водоросли лесных биогеоценозов. Москва: Наука, 130 с.].
Andreeva, V.M. 1998. Terrestrial and aerophilic green algae (Chlorophyta: Tetrasporales, Chlorococcales, Chlorosarcinales). Nauka, Saint Petersburg, 351 pp. (in Russian). [Андреева В.М. 1998. Почвенные и аэрофильные зеленые водоросли (Chlorophyta: Tetrasporales, Chlorococcales, Chlorosarcinales). Санкт-Петербург: Наука, 351 с.].
Artamonova, V.S. 1982. Soil algae of aspen-fir forest of scientific biological station "Kotorovo". In: Microbiological processes in the soils of Western Siberia (I.L. Klevenskaya, ed.), pp. 161-175, Nauka, Novosibirsk (in Russian). [Артамонова В.С. 1982. Почвенные водоросли осиново-пихтового леса стационара «Которово» // Микробиологические процессы в почвах Западной Сибири / отв. ред. И.Л. Клевенская. Новосибирск: Наука, 1982. С. 161-175].
Barcyté, D., M. Pusztai, P. Škaloud & M. Eliáš 2022. When you like other Algae: Adglutina synurophila gen. et sp. nov. (Moewusinia, Chlorophyceae), a clingy green microalga associated with Synura colonies. Protist 173:125858. CrossRef
Barcyté, D., L. Hodač & L. Nedbalová 2020. Overlooked diversity with terrestrial lifestyle in the predominantly freshwater and snow phylogroup Chloromonadinia (Volvocales, Chlorophyceae). European Journal of Phycology 55:207-222. CrossRef
Barcytė, D., L. Hodač, L. Nedbalová & J. Elster 2018a. Chloromonas arctica sp. nov., a psychrotolerant alga from snow in the High Arctic (Chlamydomonadales, Chlorophyta). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 68: 851-859. CrossRef
Barcyté, D., L. Hodač, L. Nedbalová & J. Elster 2018b. Chloromonas svalbardensis n. sp. with insights into the phylogroup Chloromonadinia (Chlorophyceae). Journal of Eukaryotic Microbiology 65:882-892. CrossRef
Boldina, O.N. 2008. Morphological types of pyrenoid organizationin green monads. Vestnik Tverskogo gosudarstvennogo universiteta, seria "Biologia i ecologia" 9:21-26 (in Russian). [Болдина О.Н. 2008. Морфологические типы организации пиреноидов у зеленых монад // Вестник ТвГУ, серия «Биология и экология». Вып. 9. С. 21-26].
Boldina, O.N. 2016. Сhlamydomonads (Chlamydomonadaceae) from St. Petersburg and the Leningrad Region: current knowledge and new records. Novosti Sistematiki Nizshikh Rastenii 50:5-22 (in Russian). [Болдина О.Н. 2016. Хламидомонады (Chlamydomonadaceae) Санкт-Петербурга и Ленинградской области: состояние изученности и новые находки // Новости систематики низших растений Т. 50. С. 5-22]. CrossRef
Boldina, O.N. & A.S. Chunaev 2020. Symbiotic chlamydomonads in algological department collection of BIN RAS. Voprosy sovremennoi algologii 2(23):79-84 (in Russian). [Болдина О.Н., Чунаев А.С. 2020. Симбиотические хламидомонады в коллекции лаборатории альгологии БИН РАН // Вопросы современной альгологии. № 2 (23). C. 79-84]. CrossRef
Broady, P.A. 1979. A preliminary survey of the terrestrial algae of the Antarctic Peninsula and South Georgia. British Antarctic Survey Bulletin 48:47-70.
Buchheim, M.A., M. Turmel, E.A. Zimmer & R.L. Chapman 1990. Phylogeny of Chlamydomonas (Chlorophyta) based on cladistic analysis of nuclear 18S rRNA sequence data. Journal of Phycology 26:689-699. CrossRef
Buchheim, M.A., C. Lemieux, C. Otis, R.R. Gutell, R.L. Chapman & M. Turmel 1996. Phylogeny of the Chlamydomonadales (Chlorophyceae): a comparison of ribosomal RNA gene sequences from the nucleus and the chloroplast. Molecular Phylogenetics and Evolution 5:391-402. CrossRef
Buchheim, M.A., J.A. Buchheim & R.L. Chapman 1997. Phylogeny of Chloromonas (Chlorophyceae): a study of 18S ribosomal RNA gene sequences. Journal of Phycology 33:286-293. CrossRef
Cărăuş, I. 2012. Algae of Romania. A distributional checklist of actual algae. Version 2.3 - third revision. Studii şi cercetări de Biologie 7:1-809.
Chatta, E.N. & O.G. Lopatovskaya 2001. Soil algoflora of the mineral spring in valley of Rivulet Chelolek (Vitim nature reserve). In: Modern problems of Baikalogia. Proceeding of young scientists, pp. 86-94, Izdatel'stvo Irkutskogo gosudarstvennogo universiteta, Irkutsk (in Russian). [Чатта Е.Н., Лопатовская О.Г. 2001. Почвенная альгофлора минерального источника долины ручья Челолек (Витимский заповедник) // Современные проблемы Байкаловедения. Сборник трудов молодых ученых. Иркутск: Из-дво Иркут. гос. ун-та. С. 86-94].
Darienko, T.M. 2012. Terrestrial algae of Zmiinyj island (Black Sea, Ukraine): general characteristic and peculiarities of species composition. Ukrainian Botany Journal 69(1):110-124.
Darriba, D., G.L. Taboada, R. Doallo & D. Posada 2012. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing. Nature Methods 9(8):72. CrossRef
Deason, T.R. & H.C. Bold 1960. Phycological studies. I. Exploratory studies of Texas soil algae. The University of Texas publication 6022:1-72.
Demchenko, E., T. Mikhailyuk, A.W. Coleman & T. Pröschold 2012. Generic and species concepts in Microglena (previously the Chlamydomonas monadina group) revised using an integrative approach. European Journal of Phycology 47:264-290. CrossRef
Doyle, J.J. & J.L. Doyle 1990. Isolation of Plant DNA from Fresh Tissue. Focus 12(1):13-15. CrossRef
Eddie, B., C. Krembs & S. Neuer 2008. Characterization and growth response to temperature and salinity of psychrophilic, halotolerant Chlamydomonas sp. ARC isolated from Chukchi Sea ice. Marine Ecology Progress Series 354: 107-117. CrossRef
Egorova, I.N. & E.A. Sudakova 2005. Epiphytic algae of the south Baikal region. Novosti Sistematiki Nizshikh Rastenii 38:47-57 (in Russian). [Егорова И.Н., Судакова Е.А. 2005. Эпифитные водоросли Южного Предбайкалья // Новости систематики низших растений. Т. 38. С. 47-57].
Egorova, I.N. 2012. The species diversity of algae in association with Rhytidium rugosum (Bryophyta) in Sokhondo reserve (Zabaikalsky territory). Botanicheskii Zhurnal 97(8): 1051-1061 (in Russian with English summary). [Егорова И.Н. 2012. Видовой состав водорослей в ассоциациях с Rhytidium rugosum (Bryophyta) в Сохондинском заповеднике (Забайкальский край) // Ботанический журнал. Т. 97, № 8. С. 1051-1061]. CrossRef
Egorova, I.N. 2016. About of epilithic algae some mountain areas of Russia and Mongolia. Izvestiya Samarskogo nauchnogo centra RAN 5(2):257-263 (in Russian). [Егорова И.Н. 2016. О водорослях скально-каменистых субстратов некоторых горных районов России и Монголии // Известия Самарского научного центра РАН. Т. 5, № 2. С. 257-263].
Egorova, I.N., G.S. Shambuyeva & T.I. Morozova 2019. Additional information about terrestrial algae of the Altai Mountains (Republic of Altai, Russia). Problemy botaniki Yuzhnoi Sibiri i Mongolii 254-259 (in Russian with English abstract). [Егорова И.Н., Шамбуева Г.С., Морозова Т.И. 2019. Дополнительные сведения о наземных водорослях горного Алтая (Республика Алтай, Россия) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии. C. 254-259]. CrossRef
Egorova, I.N., E.A. Sudakova, E.N. Maksimova & G.S. Tupikova 2020a. Terrestrial Algae of the Mountains of South Siberia and North Mongolia. Botanicheskii Zhurnal 105(2): 107-132 (in Russian with English summary). [Егорова И.Н., Судакова Е.А., Максимова Е.Н., Тупикова Г.С. 2020. Наземные водоросли гор Южной Сибири и Северной Монголии // Ботанический журнал. Т. 105, № 2. С. 107-132]. CrossRef
Egorova, I.N., M.S. Konovalov, O.V. Shergina, N.V. Dudareva & G.S. Tupikova 2020b. Algae and epilitic mosses associations of the Hedwigia P. Beauv. genus in mountain taiga of the Khentey Uplands (Zabaykalskiy Krai, Russia). Sibirskii Lesnoi Zhurnal 6:64-80 (in Russian with English abstract and references). [Егорова И.Н., Коновалов М.С., Шергина О.В., Дударева Н.В., Тупикова Г.С. 2020. Ассоциации водорослей и мохообразных рода Hedwigia P. Beauv. в горной тайге Хэнтэя (Забайкальский край, Россия) // Сибирский лесной журнал. № 6. С. 64-80].
EPSAG. 2022. Experimental Phycology and Culture Collection of Algae at the University of Goettingen. Available from: http://www.uni-goettingen.de. Last accessed 10.08.2022.
Ettl, H. 1970. Die Gattung Chloromonas Gobi emend. Wille (Chlamydomonas und Die Nächstverwandten Gattungen I). Nova Hedwigia, Beiheft 34:1-283.
Ettl, H. 1976. Die Gattung Chlamydomonas Ehrenberg (Chlamydomonas und die nächstverwandten Gattungen II). Nova Hedwigia, Beiheft 49:1-1122.
Ettl, H. 1983. Chlorophyta I. Phytomonadina. In: Süβwasserflora von Mitteleuropa (H. Ettl, J. Gerloff, H. Heynig & D. Mollenhauer, eds), pp. 1-807, Gustav Fischer Verlag, Yena.
Faktorovich, L.V. 2001. Composition and structure of soil algae association of the wood mountain profile of Aryskanyg Shivilig-Chem in Uvs-Nuur Region of Tuva. Sibirskii Ekologicheskii Zhurnal 8(4):423-429 (in Russian). [Факторович Л.В. 2001. Состав и структура почвенных водорослей лесного пояса Арысканыг Шивилиг-Хемского кластера Убсунурской котловины Тувы // Сибирский экологический журнал. Т. 8, № 4. С. 423-429].
Gálvez, F.E., M. Saldarriaga-Córdoba, P. Huovinen, A.X. Silva & I. Gómez 2021. Revealing the characteristics of the Antarctic snow alga Chlorominima collina gen. et sp. nov. through taxonomy, physiology, and transcriptomics. Frontiers in Plant Science 12:662298. CrossRef
GBIF Backbone Taxonomy. 2022. Checklist dataset. SH1178808.09FU (cf. Chloromonas actinochloris) in GBIF Secretariat. Available from: https://doi.org/10.15468/39omei. Last accessed 15.12.2022.
Gerloff, J. 1940. Beiträge zur Kenntnis der Variabilität und Systematik der Gattung Chlamydomonas. Archiv für Protistenkunde 94:311-502.
Gollerbakh, M.M. & E.A. Shtina 1969. Soil algae. Nauka, Leningrad, 228 pp. (in Russian). [Голлербах М.М., Штина Э.А. 1969. Почвенные водоросли. Ленинград: Наука, 228 c.].
Guiry, M.D. & G.M. Guiry 2018. AlgaeBase. World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. Available from: https://www.algaebase.org. Last accessed 08.08.2022.
Hall, T.A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series 41:95-98.
Hoffmann, L., L. Ector & I. Kostikov 2007. Algal flora from limed und unlimed forest soils in the Ardenne (Belgium). Systematics and Geography of Plants 77: 15-90.
Hoham, R. W. 1975. The life history and ecology of the snow alga Chloromonas pichinchae (Chlorophyta, Volvocales). Phycologia 14:213-26. CrossRef
Hoham, R.W., T.A. Bonome, C.W. Martin & J.H. Leebens-Mack 2002. A combined 18S rDNA and rbcL phylogenetic analysis of Chloromonas and Chlamydomonas (Chlorophyceae, Volvocales) emphasizing snow and other cold-temperature habitats. Journal of Phycology 38: 1051-1064. CrossRef
Hoham, R.W., J.D. Berman, H.S. Rogers, J.H. Felio, J.B. Ryba & P.R. Miller 2006. Two new species of green snow algae from Upstate New York, Chloromonas chenangoensis sp. nov. and Chloromonas tughillensis sp. nov. (Volvocales, Chlorophyceae) and the effects of light on their life cycle development. Phycologia 45:319-330. CrossRef
Hu, H.J., M. Yang, L.M. Luo & S. Chen 2015. Chlorophyta, Chlorophyceae, Order Volvocales (II), Genus Chlamydomonas. In: Flora algarum sinicarum aquae dulcis. Vol. 20, pp. [i]-xvii, 1-174, 2 pls. Beijing: Science Press (in Chinese).
Katana, A., J. Kwiatowski, K. Spalik, B. Zakrys, E. Szalacha & H. Szymanska 2001. Phylogenetic position of Koliella (Chlorophyta) as inferred from nuclear and chloroplast small subunit rDNA. Journal of Phycology 37:443-451. CrossRef
Komarov, V.L. 1905. A trip to the Tunka region and to the lake of Kosogol in 1902. Izvestiya Imperatorskogo Russkogo Geograficheskogo Obshchestva 41(1):23-154 (in Russian). [Комаров В.Л. 1905. Поездка в Тункинский край и на оз. Косогол в 1902 г. // Известия Императорского Русского географического общества. 41(1):23-154].
Konstantinova, I.A. & O.N. Boldina 2003. Comparative analisis on the cell walls of monadoid and coccoid green algae. In: Botanical explorations in Asia Russia. Materials of XI Congress of Russian Botanical Society, p. 107, Izdatel'stvo AsBuka, Barnaul (in Russian). [Константинова И.А., Болдина О.Н. 2003. Сравнительный анализ клеточных оболочек монадных и коккоидных водорослей // Ботанические исследования в Азиатской России. Материалы XI съезда Русского Ботанического общества. Барнаул: АзБука. C. 107].
Kostikov, I.Yu., P.O. Romanenko, E.M. Demchenko, T.M. Darienko, T.I. Mikhailyuk, O.I. Rybchinskii & A.M. Solonenko 2001. Soil algae of Ukraine (history and research methods, system, conspectus of flora). Fitosotsiotsentr, Kiev, 300 pp. (in Ukrainian). [Костiков I.Ю., Романенко П.О., Демченко Е.М., Дарieнко T.M., Михайлюк T.И., Рыбчинський O.И., Солоненко A.M. 2001. Водоростi грунтiв Украïни (iсторiя та методи дослiдження, система, конспект флори). Киïв: Фiтосоцiоцентр. 300 с.].
Lin, Ch.-S. & J.-T. Wu 2014. Environmental factors affecting the diversity and abundance of soil photomicrobes in arid lands of subtropical Taiwan. Geomicrobiology Journal 31:350-359. CrossRef
Liu, C., X. Huang, X. Wang, X. Zhang & G. Li 2006. Phylogenetic studies on two strains of Antarctic ice algae based on morphological and molecular characteristics. Phycologia 45:190-198. CrossRef
Levin, R.A., W.L. Wagner, P.C. Hoch, M. Nepokroeff, J.C. Pires, E.A. Zimmer & K.J. Sytsma 2003. Family-level relationships of Onagraceae based on chloroplast rbcL and ndhF data. American Journal of Botany 90:107-115. CrossRef
Lopatovskaya, O.G. & E.N. Maksimova 2010. Ionic-salt and algological characteristic of the snow cover as one of elements of the estimation of the condition of the environment. Problemy regional'noi ekologii 3:35-39 (in Russian). [Лопатовская О.Г., Максимова Е.Н. 2010. Ионно-солевая и альгологическая характеристика снежного покрова как один из элементов оценки состояния окружающей среды // Проблемы региональной экологии. 3:35-39].
Lopatovskaya, O.G., E.N. Maksimova & E.R. Khadeeva 2017. Saline Soils and Diversity of Soil Algae of Ol'khon Island at Baikal Lake. Izvestiya Irkutskogo gosudarstvennogo universiteta. Seriya "Biologiya. Ekologiya" 20:73-88. (in Russian). [Лопатовская О.Г., Максимова Е.Н., Хадеева Е.Р. 2017. Засолённые почвы острова Ольхон и видовое разнообразие почвенных водорослей // Известия Иркутского гос. ун-та. Серия «Биология. Экология». Т 20. С. 73-88].
Matsuzaki, R., H. Nozaki, N. Takeuchi, Y. Hara & M. Kawachi 2019. Taxonomic reexamination of "Chloromonas nivalis (Volvocales, Chlorophyceae) zygotes" from Japan and description of C. muramotoi sp. nov. PLoS One 14:e0210986. CrossRef
Matsuzaki, R., H. Nozaki & M. Kawachi 2018. Taxonomic revision of Chloromonas nivalis (Volvocales, Chlorophyceae) strains, with the new description of two snow-inhabiting Chloromonas species. PLoS One 13:e0193603. CrossRef
Menezes, M. 2010. Chlorophyceae. In: Catálogo de plantas e fungos do Brasil. Vol. 1 (R.C. Forzza, ed.), pp. 335-352, Rio de Janeiro: Andrea Jakobsson Estúdio; Instituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro.
Mikhailyuk, T., K. Gläser, P. Tsarenko, E. Demchenko & U. Karsten 2019. Composition of biological soil crusts from sand dunes of the Baltic Sea coast in the context of an integrative approach to the taxonomy of microalgae and cyanobacteria. European Journal of Phycology 54(3):263-290. CrossRef
Middendorf, A.F. 1867. Travel to the North and East of Siberia. In: Rastitelnost' Sibiri, pp. 69 (XLIX)-54 (LIV) Saint-Peterburg. Chast. 1. Otdelenie. 4. (in Russian). [Миддендорф А.Ф. 1867. Путешествие на север и восток Сибири // Растительность Сибири. Санкт-Петербург. Ч.1, отд. 4. С. 69 (XLIX)-54 (LIV)].
Muramoto, K., T. Nakada, T. Shitara, Y. Hara & H. Nozaki 2010. Reexamination of the snow algal species Chloromonas miwae (Fukushima) Muramoto et al., comb. nov. (Volvocales, Chlorophyceae) from Japan, based on molecular phylogeny and cultured material. European Journal of Phycology 45:27-37. CrossRef
Nakada, T., K. Misawa & H. Nozaki 2008. Molecular systematics of Volvocales (Chlorophyceae, Chlorophyta) based on exhaustive 18S rRNA phylogenetic analyses. Molecular Phylogenetics and Evolution 48:281-291. CrossRef
Nakada, T., M. Tomita, J.-T. Wu & H. Nozaki 2016. Taxonomic revision of Chlamydomonas subg. Amphichloris (Volvocales, Chlorophyceae), with resurrection of the genus Dangeardinia and descriptions of Ixipapillifera gen. nov. and Rhysamphichloris gen. nov. Journal of Phycology 52:283-304. CrossRef
NCBI 2022. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. Available from: www.ncbi.nlm. nih.gov. Last accessed 20.12.2022.
Nema M., M.L. Hanson & K.M. Müller 2019. Phylogeny of the egg-loving green alga Oophila amblystomatis (Chlamydomonadales) and its response to the herbicides atrazine and 2,4-D. Symbiosis 77:23-39. CrossRef
Novichkova-Ivanova, L.N. 1980. Soil algae of phytocenoses of the Sahara-Gobi desert region. Nauka, Leningrad, 256 pp. (in Russian). [Новичкова-Иванова Л.Н. 1980. Почвенные водоросли Сахаро-гобийской пустынной области. Ленинград: Наука, 256 с.].
Novis, P.M., R.W. Hoham, T. Beer & M. Dawson 2008. Two snow species of the quadriflagellate green alga Chlainomonas (Chlorophyta, Volvocales): ultrastructure and phylogenetic position within the Chloromonas clade. Journal of Phycology 44:1001-1012. CrossRef
Nozaki H., T. Nakada & S. Watanabe 2010. Evolutionary origin of Gloeomonas (Volvocales, Chlorophyceae), based on ultrastructure of chloroplasts and molecular phylogeny. Journal of Phycology 46:195-201. CrossRef
Patova, E.N. & I.V. Novakovskaya 2018. Soil algae of the northeastern European Russia. Novosti sistematiki nizshikh rastenii 52(2): 311-353 (in Russian with English abstract). [Патова Е.Н., Новаковская И.В. 2018. Почвенные водоросли северо- востока европейской части России // Новости систематики низших растений. 52(2):311-353]. CrossRef
Perminova, G.N., I.S. Gutishvili, & E.V. Kitaev 1989. Soil algae of the plant communities of the Baikal nature reserve. In: Algae, lichens, fungi, and mosses in the reserves of the RSFSR. Sbornik nauchnykh trudov TsNIL RSFSR, pp. 17-26, Moscow (in Russian). [Перминова Г.Н., Гутишвили И.С., Китаев Е.В. 1989. Почвенные водоросли фитоценозов Байкальского заповедника // Водоросли, лишайники, грибы и мохообразные в заповедниках РСФСР. Сб. науч. трудов ЦНИЛ Главохоты РСФСР. Москва. С. 17-26].
Pivovarova, Zh.F. 1974. Comparative characteristic of algosinusiae under some plants of mountainous steppe of the Issyk-Kul hollow of the Tien-Shan and South-East Altai. Izvestia Sibirskogo otdelenia Akademii nauk SSSR. Seria Biologicheskikh nauk 1:25-32 (in Russian). [Пивоварова Ж.Ф. 1974. Сравнительная характеристика альгосинузий под некоторыми растениями горных степей Иссык-кульской котловины Тянь-Шаня и юго-восточного Алтая // Известия Сибирского отделения Академии аук СССР. Серия биол. наук. 1:25-32].
Procházková, L., T. Leya, H. Křížková & L. Nedbalová 2019a. Sanguina nivaloides and Sanguina aurantia gen. et spp. nov. (Chlorophyta): the taxonomy, phylogeny, biogeography and ecology of two newly recognized algae causing red and orange snow. FEMS Microbiology Ecology 95:fiz064. CrossRef
Procházková, L., D. Remias, T. Řezanka & L. Nedbalová 2019b. Ecophysiology of Chloromonas hindakii sp. nov. (Chlorophyceae), causing orange snow blooms at different light conditions. Microorganisms 7:1-22. CrossRef
Procházková, L., D. Remias, T. Řezanka & L. Nedbalová 2018. Chloromonas nivalis subsp. tatrae, subsp. nov. (Chlamydomonadales, Chlorophyta): reexamination of a snow alga from the High Tatra Mountains (Slovakia). Fottea 18:1-18. CrossRef
Pröschold, T., B. Marina, U.G. Schlösser & M. Melkonian 2001. Molecular phylogeny and taxonomic revision of Chlamydomonas (Chlorophyta). I. Emendation of Chlamydomonas Ehrenberg and Chloromonas Gobi, and description of Oogamochlamys gen. nov. and Lobochlamys gen. nov. Protist 152:265-300. CrossRef
Pröschold, T. & Leliaert 2007. Systematics of the green algae: conflict of classic and modern approaches. In: Unravelling the algae: The past, present, and future of algal systematics (J. Brodie & J. Lewis, eds), pp. 123-153, Taylor & Francis, London. CrossRef
Remias, D., H. Wastian, C. Lütz & T. Leya, 2013. Insights into the biology and phylogeny of Chloromonas polyptera (Chlorophyta), an alga causing orange snow in Maritime Antarctica. Antarctic Science 25:648-656. CrossRef
Ronquist, F., M. Teslenko, P. van der Mark, D.L. Ayres, A. Darling, S. Höhna, B. Larget, L. Liu, M.A. Suchard & J.P. Huelsenbeck 2012. MrBayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Systematic Biology 61(3):539-542. CrossRef
Shushueva, M.G. 1977. Formation of algae groups on the dumps of coal mines in Kuzbass. In: Natural complexes of lower plants of Western Siberia, pp. 57-85, Novosibirsk (in Russian). [Шушуева М.Г. 1977. Формирование водорослевых группировок на отвалах угольных разработок в Кузбассе // Природные комплексы низших растений Западной Сибири. Новосибирск. С. 57-85].
Shushueva, M.G. 1980. Algae of gray forest soils of the South of Western Siberia. In: Algae, fungi, and lichens of the South of Siberia, pp. 128-137, Moscow (in Russian). [Шушуева М.Г. 1980. Водоросли серых лесных почв юга Западной Сибири // Водоросли, грибы и лишайники юга Сибири. Москва. С. 128-137].
Stanier, R.Y., R. Kunisawa, M. Mandel & G. Cohen-Bazire 1971. Purification and properties of unicellular blue-green algae (order Chroococcales). Bacteriological Reviews 35:171-205. CrossRef
Starr R.C. & Zeikus J.A. 1993. UTEX: The culture collection of algae at the University of Texas at Austin. Journal of Phycology 29:1-106. CrossRef
Sudakova, E.A. 1975. Soil algae of some plant communities of the valley of the Ushakovka River (Angara basin). In: Flora, Vegetation, and Plant Resources of Transbaikalia and Adjacent Territories. Theses of the Scientific Conf. Issue 5, pp. 62-63, Chita (in Russian). [Судакова Е.А. 1975. Почвенные водоросли некоторых фитоценозов долины р. Ушаковки (бассейн Ангары) // Тезисы к науч. конф. «Флора, растительность и растительные ресурсы Забайкалья и сопредельных территорий». Чита. Вып. 5. С. 62-63].
Sudakova, E.A. 1986. Soil algae of meadow biogeocenoses. In: Ecology of meadows in the western section of the BAM zone, pp. 35-44, Novosibirsk (in Russian). [Судакова Е.А. 1986. Почвенные водоросли луговых биогеоценозов // Экология лугов западного участка зоны БАМ. Новосибирск. С. 35-44].
Takeuchi, N., J. Uetake, K. Fujita, V.B. Aizen & S.D. Nikitin 2006. A snow algal community on Akkem glacier in the Russian Altai mountains. Annals of Glaciology 43:378-384. CrossRef
Tamura, K., G. Stecher & S. Kumar 2021. MEGA11: Molecular evolutionary genetics analysis Version 11. Molecular Biology and Evolution 38(7): 3022-3027. CrossRef
Tedersoo, L., V. Mikryukov, S. Anslan, M. Bahram, A.N. Khalid, A. Corrales, A. Agan, et al. 2021. The Global soil mycobiome consortium dataset for boosting fungal diversity research. Fungal Diversity 111:573-588. CrossRef
Trentin, R., E. Negrisolo, E. Moschin, D. Veronese, M. Cecchetto & I. Moro 2022. Microglena antarctica sp. nov. a new Antarctic green alga from Inexpressible Island (Terra Nova Bay, Ross Sea) Revealed through an integrative approach. Diversity 14:337. CrossRef
White, T.J., T. Bruns, S. Lee & J. Taylor 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: PCR Protocols: a guide to methods and amplifications (M.A. Innis, D.H. Gelfand, J.J. Sninsky & T.J. White, eds), pp. 315-322, Academic, New York. CrossRef
|
|