Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation 2025. Preprint
Article first published online: 07 NOV 2025 | DOI: 10.17581/bp.2025.14215
Triseptata orientalis sp. nov. and Leptodontidium viktortsoii sp. nov., two species from the forest-tundra soils of the Magadan Region, Russia
Vadim A. Iliushin
&
Irina Y. Kirtsideli
Komarov Botanical Institute RAS, St. Petersburg, Russia
A novel species in genera Triseptata and Leptodontidium are described as Triseptata orientalis and Leptodontidium viktortsoii. The new species were isolated from the forest-tundra soils of the Magadan region (Russia) and is represented by ex-type strain VKM F-5014 and VKM F-5013, accordingly. To characterize the species, we used a polyphasic taxonomic approach. A description based on morphological characters is given and it is shown that the new species are morphologically different from closely related species. Partial sequences of internal transcribed spacer rDNA region (ITS1-5.8S-ITS2) and 28S rDNA (LSU) were analyzed. The partial sequence of SSU (18S rDNA) was analyzed for L. viktortsoii as well. Sequences data, macro- and micromorphological characteristics distinguish T. orientalis and L. viktortsoii from all known species in genera Triseptata and Leptodontidium.
Ильюшин В.А., Кирцидели И.Ю. Triseptata orientalis sp. nov. и Leptodontidium viktortsoii sp. nov., два новых вида из почв лесотундры Магаданской области, Россия. Новые виды микроскопических грибов, принадлежащих родам Triseptata и Leptodontidium, были описаны как Triseptata orientalis и Leptodontidium viktortsoii. Новые виды были выделены из почв лесотундры Магаданской области (Россия) и представлены штаммами VKM F-5014 и VKM F-5013, соответственно. Для характеристики видов мы использовали полифазный таксономический подход. Приведенное описание на основе морфологических признаков показывает, что новый вид морфологически отличается от близкородственных видов. Были проанализированы частичные последовательности региона ITS (ITS1-5.8S-ITS2) и 28S рДНК (LSU). Также была проанализирована частичная последовательность SSU (18S рДНК) для L. viktortsoii. Данные последовательностей, макро- и микроморфологические характеристики позволяют отличить T. orientalis и L. viktortsoii от всех других известных видов родов Triseptata и Leptodontidium.
Keywords: forest-tundra, Leptodontidium, microfungi, multi-gene phylogeny, soil fungi, Triseptata, лесотундра, Leptodontidium, микроскопические грибы, мультигенная филогения, почвенные грибы
References
Ariyawansa, H.A., K.M. Thambugala, D.S. Manamgoda, R. Jayawardena, E. Camporesi, S. Boonmee, D.N. Wanasinghe, R. Phookamsak, S. Hongsanan, ... & K.D. Hyde 2015. Towards a natural classification and backbone tree for Pleosporaceae. Fungal Diversity 71: 85-139. CrossRef
Azbukina, Z.M. & I.V. Karatygin 2010. Melampsoraceous group of Uredinales in Russia: taxonomic revisions of recent years. Mikologiya i fitopatologiya 44:177-196 (in Russian with English summary). [Азбукина З.М., Каратыгин И.В. 2010. Мелампсороидная группа ржавчинных грибов в России: таксономические ревизии последних лет // Микология и фитопатология. Т. 44. С. 177-196].
Boonme, S., M.S. Calabon, R. Phookamsak, A.M. Elgorban & K.D. Hyde 2020. Triseptata sexualis gen. et sp. nov. in Latoruaceae (Pleosporales). Phytotaxa 447(4): 252-264. CrossRef
Crous, P.W., L.M. Carris, A. Giraldo, J.Z. Groenewald, D.L. Hawksworth, M. Hernández-Restrepo, W.M. Jaklitsch, M.-H. Lebrun, R.K. Schumacher, ... & A.R. Wood 2015. The genera of fungi - fixing the application of the type species of generic names - G 2: Allantophomopsis, Latorua, Macrodiplodiopsis, Macrohilum, Milospium, Protostegia, Pyricularia, Robillarda, Rotula, Septoriella, Torula, and Wojnowicia. IMA Fungus 6(1):163-198. CrossRef
de Hoog, G.S. & E.F. Hermanides-Nijhof 1977. The black yeast and allied Hyphomycetes. Studies in Mycology 15:1-122.
de Hoog, G.S. 1979. Nomenclatural notes on some black yeast-like Hyphomycetes. Taxon 28(4):347-348. CrossRef
Dokuchaeva, V.B. & N.E. Dokuchaev 2020. Detection of the rust fungus Chrysomyxa woronini Tranzschel in artificial planting of spruce trees in the Magadan Region. Vestnik DVO RAN 3:134-137 (in Russian with English summary). [Докучаева В.Б., Докучаев Н.Е. 2020. Обнаружение ржавчинного гриба Chrysomyxa woronini Tranzsche в искусственных посадках елей на территории Магаданской области // Вестник ДВО РАН. № 3. С. 134-137]. CrossRef
Egorova, L.N. 1986. Soils fungi of the Far East: Hyphomycetes. Nauka, Leningrad, 192 pp. (in Russian). [Егорова Л.Н. 1986. Почвенные грибы Дальнего Востока: Гифомицеты. Ленинград: Наука. 192 с.].
Egorova, L.N. 2003. Soil ascomycetes of the Russian Far East. Mikologiya i Fitopatologiya 37:13-21 (in Russian with English summary). [Егорова Л.Н. 2003. Почвообитающие аскомицеты российского Дальнего Востока // Микология и фитопатология. Т. 37, № 2. С. 13-21].
Egorova, L.N. 2009. Soil Zygomyceyes (Mucorales, Mortierellales) of coniferous forest of the Russian Far East. Mikologiya i Fitopatologiya 43:292-297 (in Russian with English summary). [Егорова Л.Н. 2009. Почвообитающие зигомицеты Zygomyceyes (Mucorales, Mortierellales) хвойных лесов российского Дальнего Востока // Микология и фитопатология. Т. 43, С. 292-297].
Galanina, I.A., L.S. Yakovchenko, E.V. Zheludeva & Y. Ohmura 2021. The genus Rinodina (Physciaceae, lichenized Ascomycota) in the Magadan Region (Far East of Russia). Novosti sistematiki nizshikh rastenii 55(1):97-119 (in Russian with English summary). [Галанина И.А., Яковченко Л.С., Желудева Е.В., Омура Й. 2021. Род Rinodina (Physciaceae, lichenized Ascomycota) в Магаданской области (Дальний Восток России) // Новости систематики низших растений Т. 55, № 1. С. 97-119]. CrossRef
GBIF Backbone Taxonomy 2023. Leptodontidium de Hoog in GBIF Secretariat. Checklist dataset. Available from: https://doi.org/10.15468/39omei Last accessed 31.01.2025.
Gerasimov, I.P. 1970. Natural conditions and natural resources of the USSR. The North of the Far East. Nauka, Moscow, 488 pp. (in Russian). [Герасимов И.П. 1970. Природные условия и естественные ресурсы СССР. Север Дальнего Востока. Москва: Наука. 205 с.].
Grishkan, I.B. 1994. Soil micromycetes of sphagnum larch woodlands in the upper reaches of the Kolyma river. Mikologiya i Fitopatologiya 28:28-33 (in Russian). [Гришкан И.Б. 1994. Почвенные микромицеты сфагновых лиственничных редколесий в верховьях реки Колымы // Микология и фитопатология. Т. 28. С. 28-33].
Grishkan, I.B. 1997. Mycobiota and the biological activity of soils of the upper Kolyma. Dalnauka, Vladivostok, 136 pp. (in Russian). [Гришкан И.Б. 1997. Микобиота и биологическая активность почв верховий Колымы. Владивосток: Дальнаука. 136 с.].
Hernández-Restrepo, M., J. Gené, R.F. Castañeda-Ruiz, J. Mena-Portales, P.W. Crous & J. Guarro 2017. Phylogeny of saprobic microfungi from Southern Europe. Studies in Mycology 86:53-97. CrossRef
Iliushin, V.A., I.Y. Kirtsideli & N.A. Sazanova 2022. Diversity of microfungi of coal mine spoil tips in the Magadan Region, Russia. Current Research in Environmental & Applied Mycology (Journal of Fungal Biology) 12(1):136-146. CrossRef
Isachenko, A.G. & A.A. Shlyapnikov 1989. Landscapes. Mysl, Moscow, 503 pp. (in Russian). [Исаченко А.Г., Шляпников А.А. 1989. Ландшафты. Москва: Мысль. 503 c.].
Kelly, K.L. 1964. Inter-Society Color Council - National bureau of standards color name charts illustrated with centroid colors. Government Printing Office, Washington, DC: US. 20 pp.
Kumar, S., G. Stecher, M. Li, C. Knyaz & K. Tamura 2018. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution 35:1547-1549. CrossRef
Nováková, A., V. Hubka, C. Saiz-Jimenez & M. Kolarik 2012. Aspergillus baeticus sp. nov. and Aspergillus thesauricus sp. nov., two species in section Usti from Spanish caves. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 62:2778-2785. CrossRef
O'Donnell, K. 1993. Fusarium and its near relatives. In: The fungal holomorph: Mitotic, meiotic and pleomorphic speciation in fungal systematics (D.R. Reynolds & J.W. Taylor, eds), pp. 225-233, CABI Publishing, Wallingford.
Raper, K.B. & C. Thom 1949. A manual of the penicillia. The Williams & Wilkins Company, Baltimore, 875 pp.
Rebriev, Y.A, E.M. Bulakh, N.A. Sazanova & A.G. Shiryaev 2020. New species of macromycetes for regions of the Russian Far East. 1. Mikologiya i Fitopatologiya 54(4):278-287. CrossRef
Ruíz, R.F.C. (ed.) 1988. Fungi cubenses III. Instituto de Investigaciones Fundamentales en Agricultura Tropical "Alejandro de Humboldt". Havana, Cuba.
Samson, R.A., J. Houbraken, U. Thrane, J.C. Frisvad & B. Andersen 2010. Food and indoor fungi, CBS Laboratory Manual Series 2. CBS-Fungal Biodiversity Centre, Utrecht, 390 pp.
Samson, R.A., C.M. Visagie, J. Houbraken, S.B. Hong, V. Hubka, C.H.W. Klaassen, G. Perrone, ... & J.C. Frisvad 2014. Phylogeny, identification and nomenclature of the genus Aspergillus. Studies in Mycology 78:141-173. CrossRef
Sazanova, N.A. 2015. New species in the mycobiota of Magadan oblast. Vestnik SVNC DVO RAN 1:69-76 (in Russian with English summary). [Сазанова Н.А. 2015. Новые виды в микобиоте Магаданской области // Вестник ДВО РАН. Т. 1, С. 69-76].
Sharma, R., R. Sharma & P.W. Crous. 2015. Matsushimamyces, a new genus of keratinophilic fungi from soil in central India. IMA Fungus 6(2):337-343. CrossRef
Stoeck, T., B. Hayward, G.T. Taylor. R. Varela & S.S. Epstein 2006. A multiple PCR-primer approach to access the microeukaryotic diversity in environmental samples. Protist 157(1):3 1-43. CrossRef
Stoeck, T., G.T. Taylor & S.S. Epstein 2003 Novel eukaryotes from the permanently anoxic Cariaco Basin (Caribbean Sea). Applied and Environmental Microbiology 69(9):5656-5663. CrossRef
Tamura, K. & M. Nei 1993. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution 10: 512-526.
Tan, Y.P. & S.L. Bishop-Hurley 2024. Index of Australian Fungi no. 28. Zenodo 10460343. CrossRef
Upadhyay, H.P. 1966. Soil fungi from North-East Brazil, II. Mycopathologia et Mycologia Applicata 30(3-4):276-286. CrossRef
Volobuev, S.V., S.Y. Bolshakov, A.G. Shiryaev, N.A. Sazanova, Y.A. Rebriev, O.N. Ezhov, V.A. Vlasenko, ... & I.V. Zmitrovich 2019. New species for regional mycobiotas of Russia. 4. Report 2019. Mikologiya i Fitopatologiya 53(5): 261-271. CrossRef
White, T.J., T.D. Bruns, S.B. Lee & J.W. Taylor 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: PCR protocols: a guide to methods and applications (M.A. Innis, D.H. Gelfand, J.J. Sninsky & T.J. White, eds), pp. 315-322, Academic Press, London. CrossRef
Wijayawardene, N.N., K.D. Hyde, K.C. Rajeshkumar, D.L. Hawksworth, H. Madrid, P.M. Kirk, U. Braun & S.C. Karunarathna 2017. Notes for genera: Ascomycota. Fungal Diversity 86:1-594.
Yurtsev, B.A. 1974. Problems of botanical geography of Northeast Asia. Nauka, Leningrad, 159 pp. (in Russian). [Юрцев Б.А. 1974. Проблемы ботанической географии Северо-Восточной Азии. Ленинград: Наука. 159 с.].
|
|